Protein–RNA interactions for Protein: P54709

ATP1B3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B3P54709 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATP1B3P54709 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms