Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PIP4K2AP48426 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PIP4K2AP48426 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms