Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UTRNP46939 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UTRNP46939 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UTRNP46939 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UTRNP46939 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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