Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CASP2P42575 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CASP2P42575 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP2P42575 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CASP2P42575 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms