Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLC19A1P41440 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms