Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KDM5CP41229 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KDM5CP41229 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms