Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ITGAEP38570 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms