Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GPC1P35052 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GPC1P35052 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GPC1P35052 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms