Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CDAP32320 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDAP32320 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDAP32320 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDAP32320 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDAP32320 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDAP32320 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDAP32320 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDAP32320 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDAP32320 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDAP32320 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDAP32320 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDAP32320 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDAP32320 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDAP32320 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDAP32320 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms