Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA9P31269 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms