Protein–RNA interactions for Protein: P28702

RXRB, Retinoic acid receptor RXR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRBP28702 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RXRBP28702 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RXRBP28702 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RXRBP28702 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RXRBP28702 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms