Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLD1P28340 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLD1P28340 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLD1P28340 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLD1P28340 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLD1P28340 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLD1P28340 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLD1P28340 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLD1P28340 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLD1P28340 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLD1P28340 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms