Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TNFSF4P23510 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TNFSF4P23510 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNFSF4P23510 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms