Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCL1P22362 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCL1P22362 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CCL1P22362 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms