Protein–RNA interactions for Protein: P17482

HOXB9, Homeobox protein Hox-B9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB9P17482 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HOXB9P17482 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms