Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
GNB3P16520 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
GNB3P16520 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
GNB3P16520 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms