Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGB4P16144 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms