Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HPGDP15428 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPGDP15428 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPGDP15428 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPGDP15428 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPGDP15428 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPGDP15428 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPGDP15428 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPGDP15428 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPGDP15428 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HPGDP15428 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HPGDP15428 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HPGDP15428 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HPGDP15428 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HPGDP15428 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms