Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXD8P13378 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXD8P13378 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms