Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SFTPCP11686 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SFTPCP11686 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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