Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ITGAMP11215 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
ITGAMP11215 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms