Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LAMC1P11047 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LAMC1P11047 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms