Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMEM225BP0DP42 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TMEM225BP0DP42 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms