Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
IFNA2P01563 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms