Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSD2O96028 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSD2O96028 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSD2O96028 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSD2O96028 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NSD2O96028 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSD2O96028 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSD2O96028 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSD2O96028 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms