Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CBX7O95931 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CBX7O95931 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms