Protein–RNA interactions for Protein: O95900

TRUB2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase TRUB2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB2O95900 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRUB2O95900 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms