Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLIT2O94813 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLIT2O94813 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms