Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TRMUO75648 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TRMUO75648 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRMUO75648 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRMUO75648 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TRMUO75648 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TRMUO75648 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TRMUO75648 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms