Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NPHP4O75161 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NPHP4O75161 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms