Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
TIMM17BO60830 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms