Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GMDSO60547 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GMDSO60547 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
GMDSO60547 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms