Protein–RNA interactions for Protein: O43819

SCO2, Protein SCO2 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO2O43819 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SCO2O43819 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SCO2O43819 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCO2O43819 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCO2O43819 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCO2O43819 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCO2O43819 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SCO2O43819 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SCO2O43819 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms