Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RNF13O43567 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RNF13O43567 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RNF13O43567 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms