Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXO3O43524 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXO3O43524 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms