Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRODHO43272 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PRODHO43272 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms