Protein–RNA interactions for Protein: O14737

PDCD5, Programmed cell death protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD5O14737 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PDCD5O14737 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms