Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APAF1O14727 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APAF1O14727 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APAF1O14727 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APAF1O14727 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APAF1O14727 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APAF1O14727 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APAF1O14727 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
APAF1O14727 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms