Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NPIPB9F8W1W9 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPIPB9F8W1W9 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms