Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRAMEF25A6NGN4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PRAMEF25A6NGN4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms