Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CCDC160A6NGH7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms