Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MBD3L3A6NE82 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MBD3L3A6NE82 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms