Protein–RNA interactions for Protein: A0PJX4

SHISA3, Protein shisa-3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA3A0PJX4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SHISA3A0PJX4 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms