Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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