Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PIAS3Q9Y6X2 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PIAS3Q9Y6X2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms