Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
NCOA3Q9Y6Q9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NCOA3Q9Y6Q9 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms