Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N8

CDH10, Cadherin-10, humanhuman

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Length 788 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH10Q9Y6N8 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CDH10Q9Y6N8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDH10Q9Y6N8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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