Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RHBDD3Q9Y3P4 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms