Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X7

GIT1, ARF GTPase-activating protein GIT1, humanhuman

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1Q9Y2X7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GIT1Q9Y2X7 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GIT1Q9Y2X7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms