Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X0

MED16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, humanhuman

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED16Q9Y2X0 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MED16Q9Y2X0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms